Cattive notizie per tutti i fan di Zone of the Enders: Hideo Kojima ha infatti annunciato che il progetto relativo allo sviluppo del terzo capitolo è stato sospeso con il conseguente scioglimento del team che era stato messo al lavoro.
Kojima non ha spiegato i motivi dietro la decisione, ma è lecito pensare che le vendite deludenti della Zone of the Enders HD Collection abbia contribuito in tal senso, specialmente se si considera come il game designer abbia aggiunto che Zone of the Enders 3 sarà realizzato soltanto nel caso ci sia un evidente e massiccia risposta da parte degli appassionati, cosa che al momento evidentemente è mancata.